Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9DA42 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9DA42 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9DA42 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9DA42 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9DA42 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9DA42 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9DA42 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9DA42 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9DA42 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q9DA42 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9DA42 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9DA42 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9DA42 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9DA42 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms