Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smco2Q9DA21 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms