Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efhc1Q9D9T8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efhc1Q9D9T8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms