Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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