Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2e2Q9D902 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms