Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot8Q9D8X5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms