Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D8N1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D8N1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms