Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms