Protein–RNA interactions for Protein: Q9D871

Ceacam18, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam18Q9D871 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ceacam18Q9D871 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ceacam18Q9D871 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms