Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc4Q9D844 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnajc4Q9D844 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms