Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms