Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tspan17Q9D7W4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tspan17Q9D7W4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms