Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
2310002L09RikQ9D7L5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2310002L09RikQ9D7L5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms