Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D7E4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D7E4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms