Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc94Q9D6J3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms