Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptp4a3Q9D658 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptp4a3Q9D658 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptp4a3Q9D658 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptp4a3Q9D658 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptp4a3Q9D658 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms