Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc39Q9D5Y1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc39Q9D5Y1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms