Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc81Q9D5W4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc81Q9D5W4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms