Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PudpQ9D5U5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms