Protein–RNA interactions for Protein: Q9D592

Tmbim7, RIKEN cDNA 4930511M11, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim7Q9D592 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmbim7Q9D592 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim7Q9D592 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim7Q9D592 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim7Q9D592 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim7Q9D592 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim7Q9D592 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim7Q9D592 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmbim7Q9D592 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms