Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D4W2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D4W2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D4W2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D4W2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms