Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al3Q9D4U4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2al3Q9D4U4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms