Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efhd1Q9D4J1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efhd1Q9D4J1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms