Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4933428M09RikQ9D3X3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms