Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpn3Q9D3W4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpn3Q9D3W4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms