Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snrnp35Q9D384 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms