Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Fndc8Q9D2H8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Fndc8Q9D2H8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Fndc8Q9D2H8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Fndc8Q9D2H8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Fndc8Q9D2H8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Fndc8Q9D2H8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Fndc8Q9D2H8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc8Q9D2H8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms