Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc6bQ9D289 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc6bQ9D289 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms