Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms