Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syf2Q9D198 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syf2Q9D198 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms