Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Hddc3Q9D114 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hddc3Q9D114 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Hddc3Q9D114 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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Hddc3Q9D114 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Hddc3Q9D114 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hddc3Q9D114 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hddc3Q9D114 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms