Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pbdc1Q9D0B6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pbdc1Q9D0B6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms