Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc47Q9D024 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms