Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Elp3Q9CZX0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Elp3Q9CZX0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms