Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS1

Aldh1b1, Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1b1Q9CZS1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aldh1b1Q9CZS1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aldh1b1Q9CZS1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aldh1b1Q9CZS1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms