Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis18aQ9CZJ6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms