Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Klhl35Q9CZ49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl35Q9CZ49 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl35Q9CZ49 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms