Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms