Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mgme1Q9CXC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mgme1Q9CXC3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms