Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pfdn1Q9CWM4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfdn1Q9CWM4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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