Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BccipQ9CWI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BccipQ9CWI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms