Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MINDY3Q9CV28 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MINDY3Q9CV28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms