Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkiras2Q9CR56 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkiras2Q9CR56 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms