Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ5

Ndufa6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa6Q9CQZ5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa6Q9CQZ5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa6Q9CQZ5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms