Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PompQ9CQT5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms