Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smim8Q9CQQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms