Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nicn1Q9CQM0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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