Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccer1Q9CQL2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer1Q9CQL2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms