Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufb9Q9CQJ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufb9Q9CQJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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