Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpb2Q9CQI7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms